Characterization of Antimicrobial Resistance in <i>Campylobacter</i> Species from Broiler Chicken Litter
Notice bibliographique
Résumé
Campylobacteriosis in human populations has been an ongoing issue in both developed and developing countries over the last 10 years. There is a grave concern whether poultry production plays an intermediate role as a reservoir and source of transmission. In this study, sixty-five broiler chicken Campylobacter isolates were isolated from fecal samples collected from 17 flocks in Alberta, Canada over two years (2015-2016). Campylobacter jejuni was the predominantly recovered Campylobacter species in both years. Approximately 33% (8/24) Campylobacter coli was identified in year 2016. The two most common antimicrobial resistance patterns in Campylobacter in year 2015 were tetracycline resistance (39%) and azithromycin/clindamycin/erythromycin/telithromycin resistance (29%). Only one isolate in 2015 displayed resistance to ciprofloxacin/nalidixic acid/tetracycline. The tetO gene was detected in all tetracycline resistant isolates in 2015. The cmeB gene was detected in all isolates with resistance to azithromycin/clindamycin/erythromycin/ telithromycin, and two isolates with resistance to tetracycline. Comparing the sequence of the cmeB genes from isolates with different resistance patterns revealed several single nucleotide polymorphisms. Transconjugants with three distinctly combined resistance patterns were obtained via in vitro conjugation. In conclusion, our study suggested that poultry can be a potential reservoir for and source of transmission of Campylobacter for human infection and requires an ongoing monitoring.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».