Elevated Mutation Burdens in Canadian Oat and Wheat Cultivars Released over the Past Century
Notice bibliographique
Résumé
Modern high-yielding crop cultivars are known to have narrow genetic bases, making them vulnerable to biotic and abiotic stresses. However, little is known about the extent of deleterious genetic variants (or mutation burden) present in these cultivars. An attempt was made using RNA-Seq to screen genome-wide deleterious genetic variants in 141 oat and 142 wheat cultivars released through Canadian breeding programs over the past century. The screening identified 5726 and 3022 deleterious genetic variants across all 21 chromosomes of both the oat and wheat genomes, respectively. These deleterious variants were largely harbored in a few cultivars and were involved with diverse biological processes, cellular components, and molecular functions. More highly deleterious variants were predicted in oat, than in wheat, cultivars, and different gene expression profiles at the early seedling stage were observed between oat and wheat cultivars, illustrating different genetic impacts of the oat and wheat breeding programs. Estimating mutation burdens for each cultivar revealed large variations among both the oat and wheat cultivars. These mutation burdens were found to increase from early to recent oat and wheat cultivars and were associated with higher cultivar yields. Genetic analyses also revealed genetic shifts and expansions from early to recent oat and wheat cultivars. These findings provide the first empirical evidence of elevated mutation burdens in Canadian oat and wheat cultivars and are useful for advancing plant breeding programs to minimize genetic risk.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».