Improved HIV-1 RNA detection using whole blood versus plasma in antiretroviral-treated individuals
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Currently, nucleic acid testing (NAT) platforms detect HIV-1 in plasma. Using whole blood (WB) could improve HIV-1 detectability as cellular elements may also contain HIV-1 nucleic acids. We used well-characterized paired WB/plasma panels to evaluate HIV-1 RNA detection inhibition by WB, specificity, and enhanced HIV-1 RNA detectability by WB compared to plasma. Panels included: spiked samples; NAT−/serology−, NAT+/serology+, and NAT−/serology+ blood donor samples; samples from persons with HIV (PWH) who started antiretroviral treatment (ART) at chronic infection stages; and from PWH under ART since acute/early infection. We found one false-positive result on WB testing of 100 NAT−/serology− blood donors, and evidence of modest HIV-1 detection inhibition. Among NAT-/serology+ donors, HIV-1 RNA detectability in plasma and WB was similar ( P = 0.64). Among 50 PWH starting ART at chronic infection stages, detectability was 24% in plasma and 92% in WB ( P < 0.001). Among 345 PWH on ART since acute/early infection, detectability was 10% in plasma and 16% in WB ( P = 0.013). HIV-1 RNA detectability in both plasma and WB was progressively lower for earlier Fiebig stages at ART initiation. WB increased HIV-1 detectability relative to plasma in PWH who initiated ART at all but the earliest infection stages. We failed to find enhanced HIV-1 RNA detectability by WB in NAT−/serology+ blood donors, who may include elite controllers. Enhancing HIV-1 nucleic acid detectability could improve infection ascertainment among PWH on ART with blunted serologic reactivity; investigation of breakthrough infection in PrEP users; and potentially for virus rebound monitoring in HIV-1 cure studies. IMPORTANCE Currently, tests to detect HIV genetic materials (RNA/DNA) are done using the liquid component of a blood sample (plasma). However, HIV may be present in blood cellular components, such as white cells and platelets. Here, we investigated if using whole blood (WB; liquid + cellular components) could improve HIV RNA detectability compared to plasma. WB increased HIV RNA detectability in persons with HIV under treatment, including those with early treatment initiation, but not among blood donors with positive HIV serology and undetectable HIV RNA in the donation screening. Enhancing HIV RNA/DNA detectability would support HIV diagnosis in cases with blunted serologic response, such as persons with early antiretroviral treatment initiation or pre-exposure prophylaxis users. It would also be useful for monitoring virus rebound in HIV cure studies and in blood donation screening, where high test sensitivity is required to guarantee the safety of the blood supply.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».