Does Urbanization Alter Purifying Selection? A Case Study in the Burrowing Owl
Notice bibliographique
Résumé
Urbanization is one of the most striking examples of anthropogenic disturbance dramatically altering ecosystems and evolutionary processes. In particular, natural selection and genetic drift are expected to be affected by the drastic changes in urban environmental conditions and landscape fragmentation. Whether selection strength increases or decreases in cities remains to be elucidated, especially since it is profoundly dependent on the strength of genetic drift. Using a previously published genomic dataset of 3 replicated pairs of urban and rural Argentinian populations of burrowing owls (Athene cunicularia), I investigate if urbanization affects genetic drift and the strength of purifying selection. Through genome-wide measures of ratios of deleterious to neutral diversity, I searched for potential accumulation of deleterious mutations associated with increased drift or decreased purifying selection, as well as measured the strength of purifying selection in each population by computing the distribution of fitness effects of mutations. Urban burrowing owls overall maintained nucleotide diversity levels similar to rural populations despite their small effective population sizes. Additionally, I found no evidence of genomic accumulation of deleterious mutations in urban populations, consistent with maintained genetic diversity, both suggesting a low or not yet visible, effect of genetic drift on urban populations. In contrast, the distribution of fitness effects of segregating variation revealed that the strength of purifying selection was reduced in cities, sometimes drastically (>50% weaker), compared to rural areas. These results provide new insight into how urbanization shapes natural selection and drift and show that the strength of selection can overall be reduced in cities, either because of the buffering environmental conditions or because of increased genetic drift.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».