Xpert MTB/RIF Ultra performance on bronchial specimens in diagnosing pulmonary tuberculosis in Vancouver, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Introduction. In cases where sputum is non-diagnostic or unavailable, bronchoscopy can yield high-value respiratory samples for tuberculosis (TB) diagnosis. Whilst Mycobacterium tuberculosis (MTB) complex culture remains the gold standard, molecular assays such as Xpert MTB/RIF Ultra (Xpert Ultra) are increasingly being used for rapid diagnosis. Gap Statement. Xpert Ultra is increasingly used for TB diagnosis and has been extensively evaluated on sputum specimens, but assessment of performance on bronchoscopy samples is more limited. Aim. To retrospectively evaluate the performance of Xpert Ultra on bronchoscopy specimens in comparison to culture in a low-incidence, high-resource setting. Methodology. Patients with a clinical suspicion of TB, who had non-diagnostic sputum or limited sputum production and underwent bronchoscopy between March 2019 and October 2023, were included in the study. Bronchoscopy specimens comprised bronchoalveolar lavages, bronchial washings and endobronchial ultrasound lymph node tissue biopsies. All included specimens underwent acid-fast bacilli (AFB) smear, mycobacterial culture and Xpert Ultra. Positive MTB culture was considered the reference standard for TB diagnosis. Results. One hundred thirty-five bronchoscopy samples from 126 patients were included. Cultures were positive for MTB in 47 out of 126 (37.3%) of included patients. Overall, positive percent agreement (PPA) and negative percent agreement (NPA) of Xpert Ultra to MTB culture were 93.6% and 98.7%, respectively. In 19 AFB smear-positive cases, Xpert Ultra had 100% PPA and NPA, whilst in 28 smear-negative cases, PPA and NPA were 89.3% and 98.6%, respectively. On average, positive culture results were available after 15.2 days of incubation (range, 5–42 days) versus 24 h for Xpert Ultra. Xpert Ultra PCR cycle threshold values correlated strongly with AFB-smear grade and time-to-culture positivity. Conclusion. Xpert Ultra performed on specimens collected via bronchoscopy demonstrated excellent agreement with culture, even in smear-negative cases. Our results support the use of the Ultra on bronchoscopy specimens for accurate and rapid TB diagnosis in a low-incidence setting.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».