New alleles of Arabidopsis <i>BIK1</i> reinforce its predominant role in pattern-triggered immunity and caution interpretations of other reported functions
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The receptor-like cytoplasmic kinase BIK1 and its close homolog PBL1 have been widely recognized as central components of plant immunity. However, most genetic studies of BIK1 and PBL1 functions were carried out with single T-DNA insertional mutant alleles. Some phenotypes observed in these mutants, e.g. autoimmunity, have been difficult to reconcile with the proposed role of BIK1 and PBL1 in pattern-triggered immunity. In this study, we generated multiple new alleles of bik1 and pbl1 by CRISPR-Cas9-based gene editing and systematically analyzed these mutants alongside existing T-DNA insertional lines. These analyses reinforced the central role of BIK1 and PBL1 in pattern-triggered immunity mediated by both receptor kinases and receptor-like proteins. At the same time, however, we revealed several pleiotropic phenotypes associated with T-DNA insertions that are not necessarily linked to loss of BIK1 or PBL1 function. Further analyses of newly generated bik1 pbl1 double mutants uncovered an even greater contribution of these kinases to immune signaling and disease resistance than previously appreciated. These findings clarify longstanding ambiguities surrounding BIK1 and PBL1 functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».