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Enregistrement W4411122517 · doi:10.1016/j.synbio.2025.06.003

Metabolic engineering of Escherichia coli for squalene overproduction

2025· article· en· W4411122517 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueSynthetic and Systems Biotechnology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaKey Technologies Research and Development ProgramScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityShanghai Tobacco GroupCanadian Anesthesiologists' Society
Mots-clésOverproductionSqualeneMetabolic engineeringMetabolic regulationBiotechnologyChemistryMathematicsBiologyBiochemistryMetabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Squalene, a lipophilic triterpene with multifaceted bioactivities, faces bioproduction bottlenecks in microbial hosts due to inefficient biosynthetic pathways and limited storage capacity. Here, we address these challenges through systems metabolic engineering integrating redox-balanced 3-hydroxy-3-methyl glutaryl coenzyme A reductase (HMGR) variants and membrane lipid remodeling. By developing a hybrid HMGRs system combining NADPH-dependent and NADH-preferred enzymes, squalene production reached 852.06 ± 28.95 mg/L with balanced cofactor utilization. Subsequent engineering of membrane morphology and lipid metabolism generated lipid-enriched elongated cells, through the overexpression of dgs , murG and plsC , boosting squalene production to 970.86 ± 55.67 mg/L. Implementation of delayed induction strategies coupled with 10% dodecane overlay as an in situ recovery system achieved a final squalene titer of 1267.01 mg/L in a 3 L bioreactor. Mechanistic studies revealed fatty acid (FA) and phosphatidylethanolamine (PE) as key reservoirs for squalene in E . coli , with dgs overexpression specifically promoting cellular elongation. This article provides comprehensive insights into engineering strategies and mechanistic perspectives, establishing a universal framework for hydrophobic metabolite biomanufacturing in prokaryotic hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,149
Score d'incertitude au seuil0,453

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle