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Enregistrement W4411132731 · doi:10.21105/joss.07747

SPARC-X-API: Versatile Python Interface for Real-space Density Functional Theory Calculations

2025· article· en· W4411132731 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Open Source Software · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiquePhase Equilibria and Thermodynamics
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesOffice of ScienceU.S. Department of Energy
Mots-clésPython (programming language)Computer scienceProgramming languageComputational scienceInterface (matter)Theoretical computer scienceOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Density Functional Theory (DFT) is the de facto workhorse for large-scale electronic structure calculations in chemistry and materials science.While plane-wave DFT implementations remain the most widely used, real-space DFT provides advantages in handling complex boundary conditions and scaling to very large systems by allowing for the efficient use of large-scale supercomputers and linear-scaling methods that circumvent the cubic scaling bottleneck.The SPARC-X project (https://github.com/SPARC-X)provides highly efficient and portable real-space DFT codes for a wide range of first principle applications, available in both Matlab (M-SPARC (Xu et al., 2020;Zhang et al., 2023)) and C/C++ (SPARC (Xu et al., 2021;Zhang et al., 2024)).The rapid growth of SPARC's feature set has created the need for a fully functional interface to drive SPARC in high-throughput calculations.Here we introduce SPARC-X-API, a Python package designed to bridge the SPARC-X project with broader computational frameworks.Built on the Atomic Simulation Environment (ASE (Hjorth Larsen et al., 2017)) standard, the SPARC-X-API allows users to handle SPARC file formats and run SPARC calculations through the same interface as with other ASE-compatible DFT packages.Beyond standard ASE capabilities, SPARC-X-API provides additional features including 1) support of SPARC-specific setups, including complex boundary conditions and unit conversion, 2) a JSON schema parsed from SPARC's documentation for parameter validation and compatibility checks, and 3) a comprehensive socket communication layer derived from the i-PI protocol (Ceriotti et al., 2014;Kapil et al., 2019) facilitating message passing between low-level C code and the Python interface.The goal of the SPARC-X-API is to provide an easy-to-use interface for users with diverse needs and levels of expertise, allowing for minimal effort in adapting SPARC to existing computational workflows, while also supporting developers of advanced real-space methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,651
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle