Dynamic control of Argonautes by a rapidly evolving immunological switch
Notice bibliographique
Résumé
Small RNAs (sRNAs), coupled with Argonaute proteins (AGOs), regulate diverse biological processes, including immunity against nucleic acid parasites. C. elegans possesses an expanded repertoire of at least 19 AGOs functioning in an intricate gene regulatory network (GRN). However, the regulation of AGOs and how their functions adapt to genetic or environmental perturbations remains incompletely understood. Here, we report that PALS-22, a member of an unusually expanded protein family in C. elegans, acts as a negative regulator of antiviral RNAi involving the RIG-I homolog. Loss of pals-22 enhances the silencing of transgenes and endogenous double-stranded RNAs (dsRNAs). We found that PALS-22 normally suppresses the expression of two AGOs, VSRA-1 and SAGO-2, which are activated by the bZIP transcription factor ZIP-1. When pals-22 is eliminated, vsra-1 and sago-2 are upregulated. These AGOs, in turn, play key roles in defense against foreign genetic elements and intracellular pathogens, respectively. Surprisingly, although immune genes functioning in the intracellular pathogen response (IPR) are upregulated in pals-22 mutants, removing SAGO-2 or the RNA-dependent RNA polymerase RRF-3 in these mutants downregulates these genes. This observation appears to contrast with the typical gene-silencing role of small interfering RNAs (siRNAs). Finally, the analysis of C. elegans wild isolates and lab reference strains reveals that PALS-22 regulates several germline AGOs, affecting germline mortality and transgenerational epigenetic inheritance. In summary, PALS-22 is a key genetic node that balances the trade-off between immunity and germline health by modulating the functions of different AGOs, thereby shaping the outputs of the RNAi machinery and the dynamics of epigenetic inheritance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».