<i>Neisseria gonorrhoeae</i> antimicrobial susceptibility testing: application of traditional agar dilution to a high-throughput 96-well microtiter assay
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The global rise in Neisseria gonorrhoeae infections and increasing antimicrobial resistance underscores the urgent need for accessible and efficient antimicrobial susceptibility testing methods. While accurate, the gold standard agar dilution method is labor-intensive and resource-demanding, limiting its practicality for research. To address this, we developed and validated a high-throughput 96-well microtiter assay as a viable alternative for measuring minimum inhibitory concentrations (MIC). In addition, we assessed the use of the simple-defined Kellogg’s supplement compared to the CLSI-recommended complex-defined growth supplement. Using 17 standard laboratory strains with different resistance profiles, we evaluated the assay against azithromycin, ceftriaxone, ciprofloxacin, and gentamicin. Both 96-well microtiter assays demonstrated no major errors for any antimicrobial, with some minor errors with azithromycin and consistent minor errors with gentamicin. Essential agreement (EA) and categorical agreement (CA) ranged from 33% to 100%, with gentamicin contributing the most variability across methods. This study establishes the 96-well microtiter assay with Kellogg’s supplement as a reliable and scalable tool for N. gonorrhoeae antimicrobial susceptibility testing, reducing the time and resources required for resistance profiling. IMPORTANCE The rapid emergence of antimicrobial resistance in Neisseria gonorrhoeae presents a critical challenge for global public health. Accurate and accessible methods for assessing antimicrobial susceptibility are essential for monitoring resistance trends and guiding effective treatment strategies. However, traditional methods, such as agar dilution, are labor-intensive and resource-intensive, limiting their widespread application in research. Our study introduces a 96-well microtiter assay that simplifies and scales up susceptibility testing while maintaining the accuracy of the gold standard. By validating the use of the simpler alternative, Kellogg’s supplement, we further lower the barriers to adoption in research settings. This innovation supports timely and efficient antimicrobial resistance surveillance and enhances the capacity for high-throughput testing of novel therapeutic compounds. By increasing the feasibility of susceptibility testing, this method can potentially improve response strategies against drug-resistant gonorrhea and other fastidious pathogens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».