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Enregistrement W4411159233 · doi:10.1002/ajmg.a.64133

Describing the First Canadian Cohort of Oculogastrointestinal Neurodevelopmental Syndrome Caused by <scp><i>CAPN15</i></scp> Pathogenic Variants

2025· article· en· W4411159233 sur OpenAlexaffabout
Tania Cruz Mariño, Nicolas Chrestian, Josianne Leblanc, Nadie Rioux, Yvan Labrie, Serge Rivest, Baiba Lāce, Samantha Colaiacovo, Maha Saleh

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreMcGill UniversityCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanUniversité LavalJewish General HospitalWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortImperforate anusHearing lossGenotypeSensorineural hearing lossCompound heterozygosityDiseaseMedicinePediatricsPhenotypeGeneticsInternal medicineBiologyGeneAudiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oculogastrointestinal neurodevelopmental syndrome (OGIN; OMIN #619318) is a rare autosomal recessive disorder resulting from pathogenic variants in the CAPN15 gene. OGIN syndrome has been previously seen to affect many different body systems and has been described to cause coloboma, imperforate anus, structural cardiac defects, and horseshoe kidneys. There is still little information about the phenotypic spectrum of this disease. This case series aims to describe the phenotypic spectrum and development of affected individuals. Our study includes eight patients-five patients previously described, and three newly identified patients from centers in Ontario and Quebec ranging from three to 15 years of age. All the French-Canadian patients in our cohort were homozygous for the c. 1838C>T (p. Ser613Leu) variant. We also describe a non-French-Canadian patient who is compound heterozygous for the variants c.1957G>A (p. Gly653Ser) (paternally inherited) and c.2520delC p. Val841Trpfs133 (maternally inherited). Through this cohort, we describe some rare manifestations of OGIN syndrome; all four female patients had vaginal fistulae, and four of the patients had sensorineural hearing loss. All eight patients had pancreatic insufficiency requiring pancreatic enzyme replacement. More research is needed to investigate the genotype-phenotype correlation, as well as assess long-term complications and natural history of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,494

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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