Culture- and polymerase chain reaction–based prevalence of bacterial pathogens in liver abscesses and ruminal wall tissues of beef-on-dairy feedlot cattle fed finishing diets with no additives, tylosin, or antibiotic alternatives to control liver abscesses*
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Objective Our objectives were to investigate the prevalence and concentrations of major bacterial pathogens associated with liver abscesses and ruminal epithelial tissues of beef-on-dairy heifers fed finishing diets containing no additives (negative control), tylosin, or a probiotic (yeast) and zeolite combination to control liver abscesses. Materials and Methods A total of 74 liver abscesses and 69 ruminal epithelial tissues, collected at slaughter, were subjected to culture-based methods to isolate 5 bacterial species, Fusobacterium necrophorum ssp. necrophorum , F. necrophorum ssp. funduliforme , Trueperella pyogenes , Salmonella enterica , and Escherichia coli , and to a quantitative PCR (qPCR) assay to determine prevalence and concentrations of the 2 F. necrophorum subspecies. Statistical analyses included Fisher’s exact test for prevalence and ANOVA for bacterial concentrations to compare the treatment groups. Results and Discussion Both culture method and qPCR assay indicated that the ssp. necrophorum was the dominant pathogen, and the prevalence tended to be greater in the negative control group than in the tylosin or yeast-plus-zeolite groups. The prevalence of ssp. funduliforme was not different between the treatment groups. Concentrations of both subspecies were in log 6 to 7 cfu/g and were not affected by treatment. The prevalence of T. pyogenes and S. enterica were low, but the prevalence of E. coli was high. A total of 5 liver abscesses were negative for both subspecies, suggesting that 6% of abscesses were caused by pathogens other than F. necrophorum . In ruminal tissues, the prevalence of ssp. funduliforme was greater than the ssp. necrophorum . Implications and Applications The combination of culture method and qPCR assay provided complementary assessment of the prevalence of the major pathogens in liver abscesses of beef-on-dairy cattle, which was similar to that of liver abscesses in cattle of beef breeds. This is the first study that used a qPCR assay to detect and quantify the 2 subspecies of F. necrophorum in liver abscesses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».