ATP2B1 expression identifies human hematopoietic stem cells across ontogeny with superior repopulation and self-renewal capacity
Notice bibliographique
Résumé
Summary Long-term hematopoietic stem cells (LT-HSC) maintain lifelong hematopoiesis while preserving the stem cell compartment through self-renewal. The human LT-HSC compartment is molecularly and functionally heterogeneous and also varies across ontogeny. Dissecting the molecular basis for this variation is impeded by the absence of immunophenotypic markers to resolve LT-HSC heterogeneity. Here, we identified ATPase plasma membrane Ca 2+ transporting 1 (ATP2B1/PMCA1) as a novel cell surface marker that is heterogeneously expressed by CD49f + LT-HSC across ontogeny. ATP2B1 immunophenotypic expression stratified human CD49f + LT-HSC from fetal liver (FL), neonatal cord blood (CB) and adult mobilized peripheral blood (mPB) sources into functionally distinct subpopulations in single-cell (sc) clonogenic assays. CD49f + ATP2B1 + LT-HSC exhibited superior long-term repopulation and self-renewal capacities in vivo compared to CD49f + ATP2B1 – LT-HSC. Molecular profiling by scMultiome and immunofluorescence microscopy point to enrichment of an HSC self-renewal program that includes the TFEB-endolysosomal axis in CD49f + ATP2B1 + LT-HSC. Our study provides a new tool to dissect the heterogeneous molecular programs in LT-HSC across ontogeny.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».