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Enregistrement W4411249488 · doi:10.3390/ijms26125627

Metabolomic Profiling Identifies Key Metabolites and Defense Pathways in Rlm1-Mediated Blackleg Resistance in Canola

2025· article· en· W4411249488 sur OpenAlexafffund
Xiaohan Zhu, Peng Gao, Shuang Zhao, Xian Luo, Liang Li, Gary Peng

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics, phytochemicals, and oxidative stress
Établissements canadiensThe Metabolomics Innovation CentreUniversity of AlbertaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaCanola Council of Canada
Mots-clésBlacklegMetabolomicsBiologyCanolaComputational biologyBrassicaBioinformaticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blackleg disease poses a major threat to global canola production. The resistance gene Rlm1, corresponding to the avirulence gene AvrLm1 in the pathogen Leptosphaeria maculans, has been widely used to mitigate the impact of the disease. To investigate the biochemical basis of Rlm1-mediated resistance against blackleg, we conducted an LC-MS–based analysis of a susceptible Topas double haploid (DH) line and its isogenic Rlm1-carrying resistant counterpart for metabolomic profiles during the infection process. Samples were labeled with 12C- and 13C for LC-MS analyses to enhance both chemical and physical properties of metabolites for improved quantification and detection sensitivity. Resistant plants showed early and sustained accumulation of several defense metabolites, notably pipecolic acid (PA, up to 326-fold), salicylic acid (SA), and gentisic acid (GA) in L. maculans-inoculated Topas–Rlm1 plants compared to mock-inoculated Topas–Rlm1 controls (adjusted p < 0.05), indicating activation of lysine degradation and hormonal defense pathways. Elevated glucosinolates (GLS), γ-aminobutyric acid (GABA), and melatonin precursors may further contribute to antimicrobial defense and cell-wall reinforcement. In contrast, flavonoid and phenylpropanoid pathways were down-regulated, suggesting metabolic reallocation during resistance. Exogenous application of PA, SA, GA, ferulic acid, and piperonylic acid (a known inhibitor of the phenylpropanoid pathway in plants) significantly reduced infection in susceptible canola varieties, validating their defense roles against blackleg. These results offer new insights into Rlm1-mediated resistance and support metabolic targets for breeding durable blackleg resistance in canola.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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