Three-Component Glycosylation of Transient Hemiacetals Towards Tunable BisAcetal-Based Substrates.
Notice bibliographique
Résumé
Quantitative live-cell monitoring of glycosidase activity is essential for advancing chemical biology, yet designing substrate probes that combine broad applicability with finely tunable kinetics remains a significant challenge. While Glyco-BisAcetal-Based Substrates (BABS) have proven applicable to several enzymes, their alkyl-hemiacetal core can limit turnover rates for cer-tain enzymes. Herein, we report a novel one-pot, three-component glycosylation strategy to synthesize Aryl-BABS through the trapping of transient aryl-hemiacetals. This approach enables rapid diversification of the bisacetal scaffold using various phenols, yielding a library of aryl-bisacetal substrates. Kinetic evaluation of these substrates with a model glycosidase demonstrated that these aryl-BABS are efficiently processed, with turnover rates up to two orders of magnitude faster than analogous alkyl glyco-sides and approaching those seen for activated p-nitrophenyl glycosides. Simple substitutions to the phenol lead to a 20-fold range of kinetic tunability. Crucially, stopped-flow studies combined with kinetic simulations revealed that the breakdown of the enzy-matically released aryl-hemiacetal is extremely rapid, at least 100-fold faster than alkyl-hemiacetals. This synthetic and kinetic tunability offers a powerful platform for developing advanced substrate probes, potentially enabling quantitative measurement of previously intractable glycosidases in living systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».