Abstract 2620 Culture in Physiological Oxygen and Plasma-Like Media Modulate Breast Cancer Cell Hallmarks
Notice bibliographique
Résumé
Standard cell culture conditions often fail to replicate the in vivo microenvironment, limiting the reproducibility and physiological relevance of experimental findings.For example, commonly used media such as DMEM contain supraphysiological levels of key metabolites like glucose while lacking others entirely.Additionally, standard cell culture incubators maintain near-atmospheric oxygen levels (18% O2), far exceeding the physiological oxygen levels (2-9% O2) typical of most tissues.Despite their significance, these factors are often studied independently.Here, we investigated the effects of both media composition and oxygen levels on breast cancer cell physiology.Using MCF7 cells cultured in 18% O2 or 5% O2 (physioxia) and in either DMEM or Plasmax-a physiological medium modeled after the human plasma metabolome-we performed transcriptomic, proteomic, and functional analyses.RNA sequencing revealed oxygen-and media-dependent changes in gene expression, particularly in pathways related to cell cycle regulation, metabolism, and redox homeostasis.While the overlap between differentially expressed genes and proteins was low, pathways related to proliferation and energy metabolism where also enriched in the proteomic analysis.Consequently, functional assays revealed differences in proliferation, migration, metabolic activity, glucose consumption, and reactive oxygen species production driven by different culture conditions.Generally, physiological culture conditions promoted proliferation, migration, and metabolic activity in MFC7 cells.Collectively, our results demonstrate that both oxygen levels and media composition profoundly influence cancer cell behavior, underscoring the necessity of implementing physiologically relevant culture conditions in in vitro cancer research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».