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Enregistrement W4411279767 · doi:10.1038/s41698-025-00965-y

Clonal hematopoiesis in metastatic urothelial and renal cell carcinoma

2025· article· en· W4411279767 sur OpenAlex
Aslı D. Munzur, Jack V. W. Bacon, Francine Fishbein, Cameron Herberts, Gráinne Donnellan, Cecily Q. Bernales, Karan Parekh, Gillian Vandekerkhove, David C. Müller, Yi Jou Liao, Maria Stephenson, Lucia Nappi, Daniel Khalaf, Corinne Maurice‐Dror, Kim N., Bernhard J. Eigl, C. Kollmannsberger, Maryam Soleimani, Alexander W. Wyatt

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

Revuenpj Precision Oncology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Cancer SocietyBC Cancer FoundationProstate Cancer Foundation
Mots-clésRenal cell carcinomaHaematopoiesisCancer researchUrothelial CellUrothelial carcinomaOncologyMedicinePathologyBiologyInternal medicineStem cellCancerUrotheliumUrinary bladderBladder cancerCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clonal hematopoiesis (CH) is an age-related expansion of white blood cell (WBC) progenitors linked to risk of hematological malignancy. Patients with cancer have increased CH prevalence compared to healthy populations, but the characteristics and relevance of CH in advanced urological cancers are unknown. We interrogated CH and circulating tumor DNA (ctDNA) in 299 patients with metastatic urothelial or renal cell carcinoma using error-corrected targeted sequencing of matched WBC DNA and plasma cell-free DNA (cfDNA). 73% of patients carried CH variants at ≥0.25% allele frequency, with 13% exhibiting large CH populations marked by variants ≥10%. CH presence, clone size, and genotype did not impact patient survival. However, CH variants frequently affected solid cancer driver genes and were not individually discriminable from ctDNA variants based on cfDNA features including fragment length. In contrast, matched WBC DNA sequencing to ≥25% of cfDNA depth sufficiently resolved CH from ctDNA variants. Serial profiling revealed ctDNA and CH temporal dynamics including treatment-related expansion of PPM1D-mutated CH clones following platinum chemotherapy. Our data reveal the molecular landscape of CH in urological cancers and suggest that CH interferes in clinical ctDNA genotyping. We urge test providers to comprehensively filter CH from ctDNA results using matched WBC sequencing and propose a cost-effective framework for its integration into existing plasma-only assays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,531
Score d'incertitude au seuil0,467

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle