Clonal hematopoiesis in metastatic urothelial and renal cell carcinoma
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Clonal hematopoiesis (CH) is an age-related expansion of white blood cell (WBC) progenitors linked to risk of hematological malignancy. Patients with cancer have increased CH prevalence compared to healthy populations, but the characteristics and relevance of CH in advanced urological cancers are unknown. We interrogated CH and circulating tumor DNA (ctDNA) in 299 patients with metastatic urothelial or renal cell carcinoma using error-corrected targeted sequencing of matched WBC DNA and plasma cell-free DNA (cfDNA). 73% of patients carried CH variants at ≥0.25% allele frequency, with 13% exhibiting large CH populations marked by variants ≥10%. CH presence, clone size, and genotype did not impact patient survival. However, CH variants frequently affected solid cancer driver genes and were not individually discriminable from ctDNA variants based on cfDNA features including fragment length. In contrast, matched WBC DNA sequencing to ≥25% of cfDNA depth sufficiently resolved CH from ctDNA variants. Serial profiling revealed ctDNA and CH temporal dynamics including treatment-related expansion of PPM1D-mutated CH clones following platinum chemotherapy. Our data reveal the molecular landscape of CH in urological cancers and suggest that CH interferes in clinical ctDNA genotyping. We urge test providers to comprehensively filter CH from ctDNA results using matched WBC sequencing and propose a cost-effective framework for its integration into existing plasma-only assays.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle