MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4411312610 · doi:10.1101/2025.06.10.658846

Rational Generation of Monoclonal Antibodies and Intrabodies Selective for Pathogenic TDP-43

2025· preprint· en· W4411312610 sur OpenAlexaff
Beibei Zhao, Sarah Louadi, Juliane Coutts, Ebrima Gibbs, Megan Y. Huang, Ryan J. Marina, Stefan Aigner, Parvez Alam, Mari L. DeMarco, Ian R. Mackenzie, Anke A. Djikstra, Byron Caughey, G Yeo, Johanne Kaplan, Neil R. Cashman

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaAmorfix (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNHLBI Division of Intramural ResearchNational Institutes of HealthDivision of Intramural Research, National Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésMonoclonal antibodyAntibodyVirologyChemistryBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43), encoded by the TARDBP gene, is a ribonucleoprotein associated with the pathogenesis of amyotrophic lateral sclerosis (ALS), frontotemporal dementia (FTD), and Alzheimer’s disease (AD). Under physiological conditions, TDP-43 is predominantly localized in the nucleus, where it participates in a variety of cellular functions related to RNA splicing, transport, and stability, as well as miRNA biogenesis. In disease, it is disproportionately mislocalized to the cytoplasm where it forms aggregates, which contribute to neurotoxicity and prion-like cell-to-cell propagation of pathogenic TDP-43. Targeting of misfolded aggregates of TDP-43 represents an attractive therapeutic strategy. However, development of effective immunotherapeutic agents remains a challenge, as they require stringent selectivity for misfolded TDP-43 in order to maintain the essential functions of physiologically native TDP-43. To address this issue, monoclonal antibodies (mAbs) and intrabodies were generated against an epitope in the N-terminal domain of TDP-43 that is only exposed when the protein is misfolded, but not in its properly folded form. We show that mouse and rabbit mAbs against this epitope displayed high binding affinities by surface plasmon resonance analysis and selectively reacted with pathological TDP-43 in post-mortem tissues from ALS, FTD, and AD patients. In a cell line system, human embryonic kidney (HEK) 293T cells, mAbs and corresponding intrabodies specifically reacted with cytoplasmic aggregates of transfected misfolded TDP-43 lacking the nuclear localization signal, TDP-43 ΔNLS . Functionally, mAbs inhibited cell-to-cell transmission of misfolded TDP-43 and the seeding activity of misfolded TDP-43 from FTLD brain homogenates by a novel RT-QuIC assay. Intrabodies promoted the degradation of intracellular aggregates of TDP-43 in HEK293T cells and in induced pluripotent stem cell-derived motor neurons (iPSC-MNs) from ALS patients. The results provide proof-of-concept evidence that supports selective targeting of misfolded toxic aggregates of TDP-43 as a potentially safe and effective avenue to treat neurodegenerative diseases associated with TDP-43 proteinopathy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research→Travaux en français237 207→