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Enregistrement W4411315217 · doi:10.1016/j.jceh.2025.102611

The Integration of Multi-omics With Artificial Intelligence in Hepatology: A Comprehensive Review of Personalized Medicine, Biomarker Identification, and Drug Discovery

2025· review· en· W4411315217 sur OpenAlexafffund
Praveen Manickavel, Soumita Ghosh, Mamatha Bhat

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical and Experimental Hepatology · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoWestern UniversityQueen's UniversityUniversity Health Network
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto
Mots-clésMedicineOmicsIdentification (biology)Personalized medicineBiomarkerHepatologyPrecision medicineBiomarker discoveryDrugBioinformaticsInternal medicineData scienceComputational biologyPharmacologyPathologyComputer scienceProteomicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The evolution of high-throughput technologies has expanded the role of multi-omics in hepatology, moving away from traditional hypothesis-driven research toward integrative, data-driven models. However, high cost and resource intensity have limited widespread adoption. The multi-omics datasets for liver diseases are still relatively small. Progress has been made in integrating a few omics types, particularly in combining genomics with transcriptomics, proteomics, or metabolomics for liver disease research. However, fully integrated multi-omics studies remain limited, with most research focusing on two or three omics layers rather than comprehensive multi-modal integration. Emerging approaches such as federated learning can be leveraged to securely integrate multi-omics data, advance AI-driven biomarker discovery, and enhance precision medicine strategies across institutions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,444
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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