Standardizing Nasal Fluid Processing for Respiratory Biomarker Analysis: A Comparative Study of Homogenization and Storage Methods
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Background Nasal fluid is a valuable medium for biomarker analysis in respiratory diseases due to its accessibility and proximity to relevant pathophysiological processes. However, its heterogeneous nature presents challenges for consistent biomarker detection and quantification. This study aimed to improve protein biomarker recovery and reliability by evaluating different homogenization and storage methods for nasal fluid samples. Methods Mechanical disruption techniques using syringes and commercial BioMasher units were compared for their effectiveness in analyte recovery, and the impact of pre- and post-processing of cryogenically stored nasal samples was assessed. Inflammatory protein biomarkers relevant to respiratory diseases, including interleukin (IL)-13, IL-8/ CXCL8, myeloperoxidase (MPO), CCL11/ eotaxin-1, CCL26/ eotaxin-3, elastase, myxovirus resistance protein 1 (MxA), CCL17/ TARC, CXCL10/ IP-10), and serum amyloid A (SAA), were successfully detected in the processed nasal fluid by ELISA and Luminex assays. Results Significant differences in analyte recovery were observed between homogenization methods, with greater titers of IL-5 and eotaxin-1 measured in samples processed by the syringing method. However, homogenization could be performed either before or after long-term cryogenic storage without significantly affecting protein concentrations. Spike and recovery experiments were also conducted and differences in SAA protein recovery were detected, suggesting that the matrix effects in nasal fluid can affect cytokine recovery, but variations in recovery were not significant for other biomarkers tested. Conclusions These findings demonstrate the potential of nasal fluid as a readily accessible medium with substantial potential to aid diagnosis and monitoring of respiratory diseases. However, given the significant impact homogenization protocols had on analyte recovery, the growing use of nasal fluid as a biospecimen in the respiratory field highlights the critical need for standardized protocol to ensure accuracy and reproducibility in future analyses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».