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Enregistrement W4411369104 · doi:10.1097/inf.0000000000004898

Blood And Pharyngeal Swab Polymerase Chain Reaction Testing: Diagnostic and Therapeutic Implications in Children With Acute Nonbacterial Encephalitis

2025· article· en· W4411369104 sur OpenAlexaff
Roberto Privato, Sandra Trapani, Elisabetta Venturini, Maria Moriondo, Francesco Nieddu, Chiara Azzari, Giuseppe Indolfi

Notice bibliographique

RevueThe Pediatric Infectious Disease Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfectious Encephalopathies and Encephalitis
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineEtiologyEncephalitisViral encephalitisPolymerase chain reactionInternal medicineSepsisAntibioticsOdds ratioMeningoencephalitisCerebrospinal fluidRetrospective cohort studyImmunologyVirusMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Children with acute nonbacterial encephalitis are often treated with extended antimicrobial therapies. Negative results from cerebrospinal fluid (CSF) examinations frequently lead to unnecessary prolongation of empirical treatments due to uncertain etiology. To enhance the identification rate of infectious causative agents, additional tests are increasingly performed on non-CSF specimens, including viral polymerase chain reaction (PCR) testing on blood or pharyngeal swabs. This study aimed to evaluate the impact of blood and pharyngeal swab PCR testing on the duration of empirical intravenous (IV) therapy in children with acute nonbacterial encephalitis, as well as its usefulness in identifying viral etiologies. METHODS: A single-center, retrospective observational study was conducted on children aged 28 days to 18 years hospitalized with acute, nonbacterial encephalitis from January 2019 to August 2024. Data on age, sex, clinical presentation, laboratory features, instrumental investigations, administered therapy, results of PCR testing on different specimens and identified etiology were collected. RESULTS: Among 52 encephalitis cases, viruses were detected via PCR in CSF in 9 cases (17%), pharyngeal swabs in 8 (15%) and blood in 5 (10%). Herpetic infections were more frequently found on CSF ( P < 0.001), while nonherpetic viruses were detected in non-CSF specimens in most cases. The duration of IV antibiotics was shorter in patients with positive viral PCR results from blood or pharyngeal swabs ( P = 0.009). Prolonged antibiotic therapy despite negative bacterial CSF tests was inversely associated with positive PCR in blood/pharyngeal swabs [adjusted odds ratio (aOR), 0.14; P = 0.031) and directly associated with sepsis-like presentation (aOR, 5.08; P = 0.028). No difference in IV acyclovir duration was found between those with nonherpetic viral infections and those with unidentified etiology ( P = 0.12). CONCLUSIONS: Performing viral PCR on both CSF and non-CSF specimens is associated with a higher detection rate of viral etiology and may positively impact the duration of empirical antimicrobial therapy in children with nonbacterial encephalitis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,705

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
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