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Enregistrement W4411375938 · doi:10.1111/2041-210x.70075

Toward a unified approach to modelling adaptation among demographers and evolutionary ecologists

2025· article· en· W4411375938 sur OpenAlexaff
Joanie Van de Walle, Jimmy Garnier, Timothée Bonnet, Stéphanie Jenouvrier

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilResearch Committee, Aristotle University of ThessalonikiNational Science Foundation
Mots-clésAdaptation (eye)Computer scienceEvolutionary biologyData scienceEcologyBiologyGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Demographic and evolutionary modelling approaches are critical to understanding and projecting species responses to global environmental changes. Population matrix models have been a favoured tool in demography, but until recently, they failed to account for short‐term evolutionary changes. Evolutionary‐explicit demographic models remain computationally intensive, difficult to use and have yet to be widely adopted for empirical studies. Researchers focusing on short‐term evolution often favour individual‐based simulations, which are more flexible but less transferable and computationally efficient. Limited communication between fields has led to differing perspectives on key issues, such as how life‐history traits affect adaptation to environmental change. We develop a new EvoDemo hyperstate matrix population model (EvoDemo‐Hyper MPM) that incorporates the genetic inheritance of quantitative traits, enabling fast computation of evolutionary and demographic dynamics. We evaluate EvoDemo‐Hyper MPM against individual‐based simulations and provide analytical approximations for adaptation rates across six distinct scales in response to selection. We show that different methods yield equivalent results for the same biological scenario, although semantic differences between fields may obscure these similarities. Our results demonstrate that EvoDemo‐Hyper MPM provides accurate, computationally efficient solutions, closely matching outcomes from individual‐based simulations and analytical approximations under similar biological conditions. Adaptation rates per generation remain constant across species when selection acts on fertility but vary with other vital rates. Adaptation per time decreases with generation time unless selection targets adult survival, where intermediate life histories adapt fastest. Rates per generation, defined as the relative change in individual fitness, remain constant across species and vital rates. We discuss that no general prediction emerges about which species or life‐history traits yield higher adaptation rates, as outcomes depend on life cycles, vital rates and the definition used. We provide Matlab and R code to support the application of our EvoDemo‐Hyper MPM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,287
Score d'incertitude au seuil0,424

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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