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Enregistrement W4411377934 · doi:10.1101/2025.06.13.659385

Patch deconvolution for Fourier light-field microscopy

2025· preprint· en· W4411377934 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueNear-Field Optical Microscopy
Établissements canadiensPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDeconvolutionMicroscopyFourier transformField (mathematics)Fourier analysisOpticsMaterials sciencePhysicsMathematicsMathematical analysisPure mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Imaging flow cytometry using Fourier light-field microscopy enables high-throughput three-dimensional cellular imaging, capable of capturing thousands of events per second. However, volumetric reconstruction speed remains orders of magnitude slower than the acquisition speed. The current state of art uses Richardson–Lucy algorithm, restricted to just 5-10 reconstructed per second with GPU acceleration. This limitation hinders real-time applications such as cell sorting and thus has bottlenecked the widespread adoption of 3D imaging flow cytometry. We introduce patch deconvolution, an optimisation compatible with the Richardson–Lucy framework that significantly accelerates convergence, achieving over 100-200 reconstructions per second on standard GPUs, a 20–40 fold improvement over Richardson–Lucy. Validated on both simulated and experimental datasets, patch deconvolution achieves reconstruction quality comparable to Richardson–Lucy in both static and flow data. This supports rapid cell sorting based on spatial features and enables advanced applications, such as detecting rare spatial events in large cell populations, which would otherwise be indistinguishable in traditional flow cytometry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,184
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle