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Enregistrement W4411414167 · doi:10.1038/s41588-024-02045-6

Author Correction: GWAS of multiple neuropathology endophenotypes identifies new risk loci and provides insights into the genetic risk of dementia

2025· erratum· en· W4411414167 sur OpenAlexaff
Lincoln M. P. Shade, Yuriko Katsumata, Erin L. Abner, Khine Zin Aung, Steven A. Claas, Qi Qiao, Bernardo Aguzzoli Heberle, J. Anthony Brandon, Madeline L. Page, Timothy J. Hohman, Shubhabrata Mukherjee, Richard Mayeux, Lindsay A. Farrer, Gerard Schellenberg, Jonathan L. Haines, Walter A. Kukull, Kwangsik Nho, Andrew J. Saykin, Julie A. Schneider, Mark Ebbert, Peter T. Nelson

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2025
Typeerratum
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHealth, Environment, Cognitive Aging
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute on Aging
Mots-clésNeuropathologyEndophenotypeGenome-wide association studyBiologyDementiaGenetic architectureNeuroscienceGeneticsComputational biologyQuantitative trait locusSingle-nucleotide polymorphismDiseaseMedicineCognitionInternal medicineGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

After publication of the article, several collaborators helpfully pointed out issues with genetic variant ID harmonization and effect allele coding errors, each affecting a subset of variants used in our study. The authors regret these errors and have updated the manuscript and summary statistics to correct them. Most results reported in the manuscript were not materially affected by this; however, the lead variant in the reported PIK3R5 locus associated with Braak neurofibrillary tangle (NFT) stage no longer reached genome-wide significance after correction (now P = 1.3 × 10 –7 ). Furthermore, the known Alzheimer’s Disease and related dementias (ADRD) loci CELF1/SPI1 (Braak NFT stage and CERAD score) and TMEM106B (Braak NFT stage) now reach the FDR significance threshold for association with at least one additional neuropathology endophenotype (NPE). Other results, namely P values, effect sizes and colocalization probabilities have minor changes and have been corrected throughout. Several minor typos are now also corrected. We also corrected all tables and figures based on genome-wide association study (GWAS) summary statistics. The Supplementary Information accompanying this amendment shows a detailed list of all updates. All changes discussed are reflected in the HTML and PDF versions of the article.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,103
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil0,354

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,103
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0040,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1060,055

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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