MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4411429179 · doi:10.3389/fmolb.2025.1607583

Comprehensive clinical and metabolomics profiling of COVID-19 Mexican patients across three epidemiological waves

2025· article· en· W4411429179 sur OpenAlexaff
David Alejandro García López, Joel Monárrez‐Espino, Juan Carlos Borrego, Jiamin Zheng, Rupasri Mandal, Claudia Torres-Calzada, Juan José Oropeza-Valdez, Alanne T. Nunes, Sergio Hugo Sánchez Rodríguez, Jesús Adrián López, Blanca Rodríguez, David S. Wishart, Yamilé López‐Hernández

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Biosciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLong-Term Effects of COVID-19
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)EpidemiologyProfiling (computer programming)Metabolomics2019-20 coronavirus outbreakSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)MedicineComputational biologyBiologyVirologyBioinformaticsDiseaseInternal medicineComputer scienceInfectious disease (medical specialty)Outbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: As of mid-2024, COVID-19 has affected over 676 million people worldwide, leading to more than 6.8 million deaths. Numerous studies have documented metabolic changes occurring during both the acute phase of the disease and the recovery phase, which, in some cases, contribute to the development of long COVID syndrome. Aims and methods: In this study, we aimed to evaluate clinical, laboratory, and comprehensive metabolomic data from hospitalized COVID-19 patients during the second, third and fourth waves (Alpha, Delta, and Omicron). A targeted, fully quantitative metabolomics assay (TMIC MEGA Assay) was used to measure 529 metabolites and lipids in plasma samples. The metabolomic profiles of these patients were compared according to different and relevant factors impacting COVID-19 outcome, such as age, sex, comorbidities, and vaccination status. Results: Among the 21 classes of compounds evaluated in this study, amino acids and lipids were the most dysregulated when comparing age, sex, comorbidities, vaccination status, and the different epidemiological waves. This is the most comprehensive analysis in Mexico providing absolute quantitative data for 529 metabolites and lipids measured in hospitalized COVID-19 patients, which could be used to monitor their metabolic status and clinical outcomes associated with COVID-19 infection or with long COVID syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,385
Écart entre enseignants0,354 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Molecular BiosciencesMême sujetLong-Term Effects of COVID-19Travaux en français237 207