Sulphur‐Acquisition Pathways for Cysteine Synthesis Confer a Fitness Advantage to Bacteria in Plant Extracts
Notice bibliographique
Résumé
Bacteria and plants are closely associated with human society, in fields such as agriculture, public health, the food industry, and waste disposal. Bacteria have evolved nutrient-utilisation systems adapted to achieve the most efficient growth in their major habitats. However, empirical evidence to support the significance of bacterial nutrient utilisation in adaptation to plants is limited. Therefore, we investigated the genetic and nutritional factors required for bacterial growth in plant extracts by screening an Escherichia coli gene-knockout library in vegetable-based medium. Mutants lacking genes involved in sulphur assimilation, whereby sulphur is transferred from sulphate to cysteine, exhibited negligible growth in vegetable-based medium or plant extracts, owing to the low cysteine levels. The reverse transsulphuration pathway from methionine, another pathway for donating sulphur to cysteine, occurring in bacteria such as Bacillus subtilis, also played an important role in growth in plant extracts. These two sulphur-assimilation pathways were more frequently observed in plant-associated than in animal-associated bacteria. Sulphur-acquisition pathways for cysteine synthesis thus play a key role in bacterial growth in plant-derived environments such as plant residues and plant exudates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».