MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4411441332 · doi:10.21769/bioprotoc.5377

Quantification of Neural Progenitor Cells From Zika Virus-Infected Zebrafish Embryos

2025· article· en· W4411441332 sur OpenAlexaff
Yago Côrtes Pinheiro Gomes, Aïssatou Aïcha Sow, Shunmoogum A. Patten, Laurent Chatel‐Chaix

Notice bibliographique

RevueBIO-PROTOCOL · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZika virusProgenitor cellEmbryoVirologyZebrafishBiologyProgenitorNeural stem cellVirusCell biologyStem cellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Zika virus (ZIKV), an arthropod-borne orthoflavivirus, has emerged as a global health concern due to its ability to cause severe fetal neurological disorders, leading to the congenital Zika syndrome (CZS) in neonates. Vertical transmission during pregnancy can alter neural progenitor cell (NPC) proliferation and differentiation and induce apoptosis, leading to microcephaly and other neurodevelopmental abnormalities. While mammalian models have been used to study the impact of ZIKV on NPC behavior, limitations such as high costs, dedicated time, and ethical constraints have fostered the exploration of alternative systems. The zebrafish embryo constitutes an advantageous in vivo model for studying ZIKV neuropathogenesis. Indeed, ZIKV infection phenocopies several features of the CZS while sharing a conserved neuroanatomical layout and offering genetic plasticity and unique accessibility to the infected brain compared to mammals. Here, we describe a protocol for characterizing ZIKV-induced defects of NPCs in this zebrafish model, relying on whole animal flow cytometry. Key features • This protocol introduces a novel and straightforward zebrafish-based system for studying ZIKV-induced neuropathogenesis. • The protocol employs an unbiased methodology for flow cytometry-based quantification of neural progenitor cells from whole embryos. • This protocol can be transposed to any transgenic reporter zebrafish lines producing specific fluorescent cell populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBIO-PROTOCOLMême sujetMosquito-borne diseases and controlTravaux en français237 207