Genomic evidence unveils the genetic architecture and evolution of the <i>S</i>‐locus controlling heterostyly in Rubiaceae
Notice bibliographique
Résumé
The S-locus supergene controlling heterostyly has multiple angiosperm origins and is characterized by convergent evolution in form and function. The genetic architecture of floral polymorphism has been studied in several unrelated families, but not Rubiaceae, which has the largest number of heterostylous species. We assembled genomes of the long- and short-styled morphs of distylous Mussaenda lancipetala and investigated the structure and evolution of the S-locus in three Mussaenda species to evaluate evidence for convergence in genetic architecture and gene function in unrelated families. Genome assemblies and population genomics indicated that the S-locus in M. lancipetala is comprised of three hemizygous genes - MuIAA, MuGA3ox, and MuAPs - present only in the S-morph. In each species, MuIAA, involved in the auxin response pathway, was highly expressed in pistils and floral tubes of the S-morph, and is a likely candidate gene controlling style length. Molecular evolution analysis indicated that the S-haplotype has accumulated repetitive sequences, S-linked genes showed no evidence of relaxed purifying selection, and the evolutionary assembly of the S-locus involved stepwise duplication. Our findings provide support for the prevalence of hemizygosity in S-locus genes and have identified molecular pathways underpinning convergent morphological evolution of clear adaptive significance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».