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Enregistrement W4411523604 · doi:10.1101/2025.06.20.25329825

<i>De novo</i> variants of <i>NALCN</i> differentially impact both the phenotypic spectrum of patients and the biophysical properties of the NALCN current

2025· preprint· en· W4411523604 sur OpenAlexaff
Nawale Hadouiri, Romain Baudat, Paloma Parra‐Díaz, Isabel del Pino, Sandra Whalen, Sarah Grotto, Theresa Brunet, Melanie Brügger, Dana Marafi, Katharina Vill, Damien Lederer, Deniz Karadurmus, Julie Désir, Marie‐Cécile Nassogne, M Favier, Siddharth Srivastava, Élise Boucher, Jonathan Lévy, D.B. Young, Gy. Horváth, I. Marey, Chiara Fiorillo, Heike Weigand, Amelle Shillington, Lila Stange, Aditi I Dagli, Emanuela Argilli, Carolyn Le, Elliott H. Sherr, Bo Hoon Lee, Ryan Gates, Isabelle Maystadt, Marie Deprez, Gaëtan Lesca, Gilles Rode, Valentin Ruault, Luca Soliani, Evamaria Lanzarini, Alison Eaton, François D. Morneau-Jacob, Annapurna Poduri, Stephanie Sacharow, Stephen R. Chorney, Elisa Rahikkala, Vasileiou Georgia, André Reis, M. Pauly, Ulrike Hüffmeier, Cornelia Kraus, Hamish S. Scott, Daniel G. Calame, Jeremy A. Tanner, Egidio Spinelli, Frédéric Tran Mau‐Them, Mathieu Gueugnon, François Lébeaupin, Laurence Faivre, Philippe Lory, Christel Thauvin‐Robinet, Arnaud Monteil

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of Alberta HospitalUniversity of AlbertaBC Children's HospitalUniversity of British ColumbiaVancouver General Hospital
Organismes subventionnairesConseil régional de Bourgogne-Franche-ComtéAgencia Estatal de InvestigaciónAgence Nationale de la RechercheEuropean CommissionHope Foundation
Mots-clésPhenotypeBiologyGeneticsMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Na + leak channel NALCN regulates the resting membrane potential and consequently cell excitability of several cell types, including neurons. Studies of animal models demonstrated that NALCN is involved in fundamental physiological functions such as respiratory rhythm, circadian rhythm, sleep, locomotor behavior and pain perception. Pathogenic variants of NALCN have been associated with ultra-rare developmental disorders characterized by a wide range of symptoms with variable severity. We and others previously showed that pathogenic variants of NALCN can be categorized in 2 groups. The first group corresponds to inherited biallelic loss-of-function variants with patients suffering from the IHPRF1 syndrome (OMIM #615419). The second one corresponds to de novo gain-of-function variants that cause the CLIFAHDD syndrome (OMIM #616266). In this study, we provide a standardized phenotypic description of a large group of 35 individuals with de novo pathogenic variants of NALCN . In addition, we performed functional studies of several of these variants using the patch clamp technique in a recombinant system. We highlight a large heterogeneity in terms of both expressed symptoms and their severity. By contrast with previous reports only showing a pure gain-of-function effect of de novo pathogenic variants, we found that de novo variants of NALCN differentially impact the biophysical properties of the NALCN current and likely influence cell excitability. To conclude, de novo variants of NALCN differentially impact the biophysical properties of the NALCN current. We hypothesize that this may at least partly explain the phenotypic diversity observed in patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,281
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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