The dual‐coding gene <i>SLC35A4</i> protects against oxidative stress
Notice bibliographique
Résumé
Alternative proteins (AltProts) represent a newly recognized class of biologically active proteins encoded from alternative open reading frames (AltORFs) within already annotated genes. This study focuses on the SLC35A4 gene, which encodes both the reference protein SLC35A4 and the alternative protein AltSLC35A4. Using a combination of microscopy and biochemical analyses, we confirmed the presence of AltSLC35A4 in the inner mitochondrial membrane, resolving previous conflicting reports. Previous studies employing ribosome profiling have revealed that during oxidative stress induced by sodium arsenite, the reference coding sequence of SLC35A4 exhibits the largest increase in translational efficiency among all cellular mRNAs. Our results confirmed this translational upregulation, with the emergence of SLC35A4 protein isoforms during oxidative stress in an upstream ORF-dependent manner. Notably, the expression of AltSLC35A4 remained unchanged during oxidative stress. Knock out of SLC35A4 or AltSLC35A4 enhanced sensitivity to oxidative stress in a rescuable manner, indicating a direct implication for these proteins in stress resistance. In conclusion, our research provides compelling evidence for the functional significance of the dual-coding nature of SLC35A4 for resistance to oxidative stress and highlights the importance of considering AltProts in the functional study of eukaryotic genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».