High-throughput sequencing metabarcoding and network analysis elucidate the effects of soil fumigation and biostimulant on potato yield, rhizoctonia canker, and fungal community
Notice bibliographique
Résumé
This study investigated the impact of chloropicrin fumigation and a Bacillus species-based biostimulant applied alone or in combination in soil of potato crop over five key time-points in season. Rhizoctonia canker incidence, potato yield and the effect on the fungal community have been monitored. Quantitative PCR and high throughput metabarcoding sequencing were used to assess soil fungal diversity, specifically biomass, richness, composition and network interactions. Potato gross yield increased by 7.06% (23.5 cwt. acre -1 ) with fumigation alone and by 8.41% (28 cwt. acre -1 ) with biostimulant applied to fumigated soil in comparison to non-fumigated control treatment. Net yield losses caused by rhizoctonia canker exceeded 20% in control plots, while both treatments reduced rhizoctonia canker index by 30% and yield losses to less than 5.6%. Fumigation alone reduced fungal abundance during the season, but the biostimulant slightly increased the mean and variability of fungal abundance. Shannon and Evenness diversity indices decreased in fumigated plots, while the biostimulant increased the variability of Chao1 and Observed ASVs indices throughout the season. Biostimulant application promoted rapid late−season fungal recolonization, enlarged connectivity among taxa in non−fumigated soil, and, when combined with fumigation, eliminated the late−season resurgence of Rhizoctonia solani detected in fumigation−only plots. Fumigation also delivered early-season knock-downs of Fusarium spp. (10-fold reduction) and Colletotrichum coccodes (≥3-fold), yet these both opportunists partially rebounded by harvest while the biostimulant had little effect on these genera. Alternaria spp. and Verticillium nubilum stayed sporadic (<0.5 % reads) but were consistently lowest in fumigated soils. Overall, integrated fumigant–biostimulant management delivered the greatest season−long suppression of pathogenic fungi, the most resilient and functionally connected fungal network, and the highest tuber yield, demonstrating that coupling targeted chemical fumigation with microbial stimulation can reconcile disease control with soil microbiome monitoring in intensive potato systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».