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Enregistrement W4411575859 · doi:10.1038/s42003-025-08274-7

Bifidobacterium deficit in United States infants drives prevalent gut dysbiosis

2025· article· en· W4411575859 sur OpenAlexaff
John B. Jarman, Pedro J. Torres, Sean P. Stromberg, Hirokazu Sato, Angelica Ladrillono, Shannon Pace, Norma Martínez Jiménez, Robert J. Haselbeck, Richard A. Insel, Stephen Van Dien, Stephanie J. Culler

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastroesophageal reflux and treatments
Établissements canadiensPersephone Productions
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDysbiosisBifidobacteriumGut floraMedicineBiologyImmunologyGeneticsBacteriaLactobacillus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The composition of the infant gut microbiome is critical to immune development and noncommunicable disease (NCD) trajectory. However, a comprehensive evaluation of the infant gut microbiome in the United States is lacking. The My Baby Biome study, designed to address this knowledge gap, evaluated the gut microbiomes of 412 infants (representative of U.S. demographic diversity) using metagenomics and metabolomics. Regardless of birth mode and/or feeding method, widespread Bifidobacterium deficit was observed, with approximately 25% of U.S. infants lacking detectable Bifidobacterium. Bifidobacterium-dominant microbiomes exhibit distinct features when compared to microbiomes with other dominant microbial compositions including reduced antimicrobial resistance and virulence factor genes, altered carbohydrate utilization pathways, and altered metabolic signatures. In C-section birth infants, Bifidobacterium tended to be replaced in the human milk oligosaccharide utilization niche with potentially pathogenic species. Longitudinal health outcomes from these infants suggest that the disappearance of key Bifidobacterium may contribute to the development of atopy. The My Baby Biome Study demonstrates that three gut microbiome community clusters exist in infants in the United States. These compositions vary on the prevalence and abundance of Bifidobacterium and impact risk for the development of atopic disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,394

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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