On the carbodiimide conjugation of DNA to mercapto-undecanoic acid-terminated SAMs on gold: an electrochemical and fluorescence imaging study
Notice bibliographique
Résumé
Bioconjugation of DNA to alkylthiol self-assembled monolayer (SAM)-modified gold surfaces via carbodiimide chemistry was studied using fluorophore labeled DNA. The extent and distribution of modification of the mercaptoundecanoic acid (MUA) SAM on a single-crystal gold bead electrode was characterized using in situ electrochemical fluorescence imaging. The uniformity of bioconjugation and the influence of the underlying surface crystallography were measured. The conditions for bioconjugation of dilute solution (1 μmol/L) of an amine and fluorophore labelled DNA (NH 2 -DNA-TYE665) to the N-hydroxysuccinimide (NHS)-ester activated MUA SAM were found to be successful using high concentrations of NHS and 1-ethyl-3-(3-dimethylamino propyl carbodiimide). The resulting DNA surface coverage was dependent on the underlying surface crystallography with larger coverages measured from surfaces composed of higher index planes than the atomically smoother low index planes. Some control over the DNA surface coverage was achieved by manipulating the labeling conditions, but reproducible surface modifications were challenging to achieve. The reproducibility of surface modification was shown to be a result of variance in the bioconjugation process rather than the quality of the electrode surfaces used or the initial MUA SAM as determined by capacitance. The presence of nonspecifically adsorbed DNA was observed using fluorescence imaging during electrochemistry, which made quantitative optimization difficult. Average measurements of the interfacial capacitance or the fluorescence intensity did not reveal the presence of this nonideal adsorbed DNA highlighting the need for more comprehensive surface analysis of bioconjugated electrode surfaces when prepared with carboiimide chemistry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».