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Enregistrement W4411588552 · doi:10.1158/0008-5472.can-24-3349

The C-Terminal Kinase Domain–Binding and Suppression Motif Prevents Constitutive Activation of FGFR2

2025· article· en· W4411588552 sur OpenAlexaff
Daniel Zingg, Chi‐Chuan Lin, Julia Yemelyanenko, Łukasz Wieteska, Sjors M. Kas, Onno B. Bleijerveld, Xue Chao, Jinhyuk Bhin, Catrin Lutz, Ellen Wientjens, Sjoerd Klarenbeek, Giulia Zanetti, Stefano Annunziato, Bjørn Siteur, Eline van der Burg, Anne Paulien Drenth, Marieke van de Ven, Lodewyk F.A. Wessels, Maarten Altelaar, John E. Ladbury, Jos Jonkers

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesKWF KankerbestrijdingMinisterie van Volksgezondheid, Welzijn en SportOncode InstituteSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungWellcome TrustNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekCancer Research UK
Mots-clésBiologyReceptor tyrosine kinaseTyrosine kinaseFibroblast growth factor receptorProtein kinase domainFibroblast growth factor receptor 2ExonMolecular biologyGeneKinaseCell biologyGeneticsCancer researchSignal transductionFibroblast growth factorReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic alterations in receptor tyrosine kinase genes can generate potent oncogenic drivers. Truncation of the FGFR2 gene by its last exon 18 (E18) is caused by structural alterations, such as focal amplifications and gene fusions/rearrangements, as well as by mutations. All the E18-truncating FGFR2 variants (FGFR2ΔE18) act as strong driver alterations in cancer, and they commonly encode a receptor lacking the carboxy (C) terminal tail. In this study, we analyzed a compendium of Fgfr2-E18 variants to uncover the mechanism by which loss of the C-tail renders FGFR2 oncogenic. Although permutation of previously annotated C-terminal FGFR motifs did not recapitulate the tumorigenicity of FGFR2ΔE18, the functional annotation efforts led to the discovery of a C-terminal phenylalanine-serine motif that mediates binding of the C-tail to the kinase domain and thereby suppresses FGFR2 kinase activity. The permutation of this kinase domain-binding and suppression motif in conjunction with other FGFR2-regulatory C-terminal sites fully phenocopied the oncogenic competence of FGFR2ΔE18. Together, these findings delineate how the C-terminal tail prevents FGFR2 from aberrant oncogenic activation. SIGNIFICANCE: A C-terminal phenylalanine-serine motif suppresses FGFR2 kinase activity by mediating binding of the C-terminal tail to the kinase domain, explaining how C-terminal truncation activates FGFR2 to promote tumorigenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,366 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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