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Enregistrement W4411590044 · doi:10.1101/2025.06.23.661028

Establishing <i>Vibrio natriegens</i> as a high-performance host for acetate-based poly-3-hydroxybutyrate production

2025· preprint· en· W4411590044 sur OpenAlexaff
Roland J Politan, Simona Della Valle, Lane Pineda, J. C. Joshi, Christian Euler, Gavin R. Flematti, Georg Fritz

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesWoodside
Mots-clésBioprocessBioplasticBiomass (ecology)Carbon sourceBiomanufacturingMetabolic engineeringSodium acetateBiochemical engineeringRaw materialBiotechnologyBiologyChemistryFood scienceBiochemistryGeneOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Acetate can be a sustainable and renewable carbon source which holds significant promise for biotechnological production but is underutilized industrially due to limited microbial efficiency. Vibrio natriegens , recognized for exceptionally fast growth rates, represents a compelling host for developing efficient acetate-based bioprocesses. In this study, adaptive laboratory evolution significantly enhanced V. natriegens ’ ability to grow on acetate as the sole carbon source, achieving an 89% increase in growth rate. Genetic and transcriptomic analyses revealed key adaptations improving acetate uptake and metabolism via increased salt tolerance, boosted Pta/AckA pathway activity, and rewired quorum sensing. Further metabolic engineering and bioprocess optimization enabled the evolved strain to reach high cell densities and efficiently convert acetate into the bioplastic poly-3-hydroxybutyrate (PHB), with productivities up to 0.27 g/L/h and PHB accumulation reaching 45.66% of cell biomass. These advances position V. natriegens as a highly promising microbial platform for sustainable, scalable, and cost-effective biomanufacturing using acetate as green feedstock.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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