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Enregistrement W4411590428 · doi:10.1101/2025.06.17.660222

Pronounced Genetic Structure Associated With Differences in a Reproductive Trait and Climatic Barriers in Canadian Populations of the Western Toad ( <i>Anaxyrus boreas</i> )

2025· preprint· en· W4411590428 sur OpenAlexafffundabout
Jayna C. Bergman, Juan Enciso‐Romero, Gregory B. Pauly, Roseanna Gamlen‐Greene, Melissa Todd, Julie A. Lee‐Yaw

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensGovernment of British ColumbiaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsAlberta Conservation Association
Mots-clésRange (aeronautics)BiologyEcologyPopulationAmphibianBiodiversityTraitSpecies complexGeographyDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Aim Identifying genetic groups within species' ranges is critical for inventorying diversity and delineating conservation units. For many North American amphibians, limited knowledge of genetic structure in Canada constrains effective conservation decision‐making. The western toad ( Anaxyrus boreas ) has an extensive distribution in western North America and, with a large part of its range in Canada, represents an opportunity to fill gaps in our understanding of genetic structure in this part of the country. Curiously, toads to the east of the Canadian Rocky Mountains (CRMs) have a vocal sac and produce a distinct advertisement call, whereas toads to the west of the CRMs and in southern parts of the species' range lack these traits. We aimed to evaluate genetic structure across the Canadian range of western toads to determine whether these ‘Calling’ and ‘Non‐calling’ populations are genetically distinct. Location British Columbia and Alberta, corresponding to east–west coverage of the Canadian range of western toads. Methods We genotyped individuals using reduced representation sequencing (ddRAD‐seq) and used population genomic methods to quantify genetic structure. We examined spatial agreement between observed genetic groups and the distribution of calling and non‐calling individuals based on the original phenotypic data used to describe these groups. Finally, we used ecological niche models to explore differences in climatic space occupied by each population and test whether climate barriers may play a role in shaping genetic boundaries. Main‐Conclusions Our results show that Calling and Non‐Calling populations of western toads in Canada not only differ in key reproductive traits, but represent distinct genetic groups separated by an area of low climatic suitability. We additionally find support for a third, undescribed genetic group in the southern CRMs. These results contribute to our understanding of genetic structure in Canada and highlight the potential for additional, overlooked groups within the northern parts of species' ranges.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,225

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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