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Enregistrement W4411607003 · doi:10.1101/2025.06.18.660339

Integrated genetic screening reveals FEN1 as a driver of stemness and temozolomide resistance in glioblastoma

2025· preprint· en· W4411607003 sur OpenAlexaff
Benjamin Brakel, Dillon McKenna, Anish Puri, Vaseem Shaikh, Manoj Singh, Ali Saleh, Abdo-jose Tomajian, Nicholas Mikolajewicz, Marcello Beltrami, Alisha Anand, Petar Miletic, Kevin R. Brown, David Tieu, William Maich, Sabra K. Salim, Yujin Suk, Minomi Subapanditha, Deena M.A. Gendoo, Chitra Venugopal, Jason Moffat, Sachin Katyal, Chirayu Chokshi, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of ManitobaUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTemozolomideGlioblastomaResistance (ecology)Cancer researchMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glioblastoma (GBM) is a lethal brain tumor with limited response to standard of care chemoradiotherapy. In this study, we conducted genome-wide CRISPR knockout screening in patient-derived glioblastoma stem cells (GSCs) to identify genetic dependencies of cell survival and therapy resistance. Our screening identified flap endonuclease 1 (FEN1) as a key driver of GSC survival, with enhanced dependency under temozolomide (TMZ) treatment. Genetic perturbation of FEN1 reduced GSC self-renewal and proliferation in vitro, and prolonged survival in a patient-derived xenograft model of GBM. FEN1 inhibition (FEN1i) preferentially affected highly aggressive or recurrent GBM models compared with less aggressive GBMs and healthy neural stem cells. Moreover, FEN1 inhibition synergized with TMZ only in these aggressive FEN1i-sensitive GSCs, providing cancer-selective killing and TMZ sensitization in the most untreatable of GBMs. Mechanistically, FEN1i-sensitive GSCs exhibited greater proliferation and sphere formation, while stalling their proliferation conferred resistance to FEN1 inhibition. Single-cell transcriptomics further linked FEN1 expression to stemness and the DNA damage response, elucidating broader determinants of FEN1 dependency. These findings establish FEN1 as a promising therapeutic target in GBM, offering a strategy for both selective targeting and enhancement of TMZ efficacy in aggressive cancers. Statement of Significance This study identifies FEN1 as a key vulnerability of glioblastoma stem cells, revealing its role in therapy resistance and stemness, and proposes FEN1 inhibition as a strategy to enhance temozolomide efficacy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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