Cells resist starvation through a nutrient stress splice switch
Notice bibliographique
Résumé
Introns are common features of eukaryotic genes, typically removed through splicing to produce functional RNAs. In yeast, some introns play roles beyond host gene expression, mediating cellular responses to nutrient depletion. However, the mechanisms underlying these functions remain unclear. Here, we show that intron-dependent resistance to starvation is mediated by changes in spliceosome stoichiometry driven by a differential increase in the abundance of U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP). Increased levels of U1 snRNP enhance its binding to, and promote splicing of, introns needed for improved tolerance to starvation. Nutrient depletion both increases and decreases the removal of different sets of introns. Remarkably, only introns that are more efficiently spliced out under starvation conditions are essential for resisting starvation. By investigating the mechanism using immunoprecipitation assays of different spliceosomal components, we found that the two sets of introns are differentially bound by U1 snRNP: starvation-induced introns are highly bound by U1, whereas underspliced introns bind less U1 snRNP in nutrient-limited conditions. Consistently, disrupting U1 interactions by mutating the 5' splice site or deleting nonessential U1 components significantly impairs starvation tolerance. These findings reveal a spliceosome-driven mechanism in which selective U1 recruitment to specific introns adapts cells to nutrient stress.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».