Clinical significance of preleukemic somatic <i>GATA1</i> mutations in children with Down syndrome
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT: Children with Down syndrome (DS) have a high risk of GATA1-associated myeloid leukemia (ML-DS) before age 4 years. Somatic N-terminal GATA1 mutations (GATA1s) are necessary, but not sufficient, for ML-DS, but their significance at birth for individual babies and whether mutations occur after birth is unclear. To address these questions, we performed a prospective study of newborns with DS using next-generation sequencing-based GATA1 mutation analysis, with hematologic and clinical evaluation and follow-up for the window of ML-DS risk. Of 450 neonates with DS, 113 (25%) had GATA1s mutations, among whom 20/113 (17.7%) had multiple mutations and 59 (52%) were clinically silent. Variant allele frequency (VAF) varied from 0.3% to 89%. VAF positively correlated (P < .0001) with the percent blasts, leukocytes, dyserythropoiesis and dysmegakaryopoiesis scores, and clinical disease severity, and negatively with hemoglobin, although only 4/113 were anemic. GATA1s mutations were detected from 28 weeks gestation; the highest frequency (45%) was at 34 to 35 weeks, whereas mutation frequency in early fetal samples (<20 weeks) was <4% (2/57). GATA1s clones (VAF, percent blasts) fell rapidly postnatally, becoming undetectable by 6 months, except in neonates who developed ML-DS. Of 110 surviving neonates, 7 (6.4%) developed ML-DS at a median age of 17.5 months. GATA1s clone size at birth was the only predictor of ML-DS. No neonates lacking GATA1s mutations acquired mutations after birth or developed ML-DS. Taken together, the fetal environment is essential for GATA1s mutation selection and expansion of GATA1s clones. Rates of leukemic transformation of GATA1s clones detected at birth are low, but clones that persist >6 months transformed.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».