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Enregistrement W4411697216 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-sh383

The structural basis for the selectivity of sulfonamide-based inhibitors of carbonic anhydrase isoforms IX and XII: A comprehensive review of the crystallographic data

2025· review· en· W4411697216 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme function and inhibition
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversiti MalayaAlliance de recherche numérique du CanadaGovernment of OntarioUniversity of Windsor
Mots-clésSulfonamideCarbonic anhydraseGene isoformChemistrySelectivityStereochemistryEnzymeCombinatorial chemistryBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxia, a shortage of oxygen arising from a cancer tumour’s inability to sufficiently vascularize in response to the metabolic demands, reliably alters the regulation of an array of genes in solid cancers, including the significant upregulation of carbonic anhydrases (CAs). CAs are a ubiquitously expressed family of zinc-dependent metalloenzymes that maintain pH homeostasis by catalyzing the interconversion of carbon dioxide and water to bicarbonate and protons. Most of the 15 human α-CA isozymes are overexpressed in cancers, but CA IX and CA XII in particular have expression profiles that make them both promising diagnostic and prognostic candidates, and putative anticancer drug targets as their inhibition in healthy tissue is likely tolerated; however, it is a daunting task to design inhibitors selective for these two cancer-associated CAs due to the high structural similarity among all the human CAs, and the dangers inherent in pan-CA inhibition. Fortunately, this is becoming feasible with the accumulation of structural information arising from crystallography and Cryo-EM experiments—unfortunately, this data must be curated by the researcher as it is not analyzed in a single place. This review addresses this problem by discussing all available crystal data of ligand-cocrystallized CA IX and CA XII, and then juxtaposes these structures with those of CA II (the ubiquitous CA) complexes to better understand what features lend themselves to ligand specificity. The resulting comparative analysis of the 64 X-ray structures of sulfonamides cocrystallized with CA II, CA IX, and CA XII can help focus attention on promising avenues of future experimentation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,901
Score d'incertitude au seuil0,485

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle