Cellular responses to thermal stress and moderate oxygen limitation in juvenile lake trout
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Lake trout (Salvelinus namaycush) is an important food fish in northern communities, inhabiting cool, well‐oxygenated water, but climate change is reducing available habitat, with extended summer stratification of lakes creating an upper thermal barrier (~15°C) and lower dissolved oxygen (DO) boundary (4–7 mg L−1). Together, these environmental factors can influence tolerance thresholds and climate change may lead to abiotic factors exceeding these physiological thresholds in lake trout habitats. Thresholds can shift with environmental acclimation in lake trout populations, but the functional basis of this shift has yet to be examined. The abundance of transcripts offers insight into underlying cellular responses to environmental stressors that can provide an early warning of adverse physiological outcomes. Here, we used a stress‐response transcriptional profiling chip to investigate a suite of genes involved in thermal and general stress in lake trout acclimated to a range of temperatures (6–18°C) and two DO conditions (~10 or ~6 mg L−1), as well as following acute thermal stress (i.e. CTmax). Transcriptional profiles were assessed in the gill, liver and epidermal mucus. Generally, fish acclimated to the greatest combined stressor (i.e. 18°C and 6 mg L−1 DO) had the largest transcriptional response, suggestive of a transition from a routine stress response to an extreme survival response. A noted temperature dependence occurred in liver tissue, which was not evident in gill or mucus tissues. Further, transcriptional responses in the gill and mucus were highly correlated (r = 0.74–0.87), highlighting the potential use of these tissues for non‐lethal sampling methods to enhance management and conservation strategies for lake trout.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».