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Enregistrement W4411706444 · doi:10.1007/s11306-025-02286-4

Metabolomic alterations in human brain microvascular endothelial cells induced by traumatic injury

2025· article· en· W4411706444 sur OpenAlexaff
David Tweddell, Eric K. Patterson, Mark Daley, Gediminas Cepinskas, Douglas D. Fraser

Notice bibliographique

RevueMetabolomics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraumatic Brain Injury and Neurovascular Disturbances
Établissements canadiensChildren’s Health Research InstituteLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTraumatic brain injuryMetabolomicsMolecular medicineMedicineNeuroscienceBiologyPathologyBioinformaticsInternal medicineCancerCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Altered metabolic pathways are critical in the progression of traumatic brain injury (TBI). Identifying differentially abundant metabolites (DAMs) from specific cell types can offer valuable diagnostic and prognostic insights. OBJECTIVE: This study aimed to characterize the metabolomic profile of injured human brain microvascular endothelial cells (hBMEC) at 2-, 12-, 24-, and 48 h post-injury. METHODS: Using an in vitro TBI model, we analyzed metabolites in cell culture media through a combination of direct injection mass spectrometry and a custom reverse-phase LC-MS/MS assay. We evaluated 644 metabolites at each time point. RESULTS: Phosphatidylcholines were significantly upregulated across all time intervals. At 2- and 12 h post-injury, the most significantly upregulated metabolites included sphingomyelin (OH) C22:1, ethylmalonic acid, and methylhistidine, while guanosine and the combination of butyric acid + isobutyric acid were the most downregulated. At 24 and 48 h, deoxyadenosine and inosine, respectively, emerged as the most upregulated metabolites, with butyric acid + isobutyric acid and quinoline-4-carboxylic acid showing the greatest downregulation. CONCLUSION: Metabolomic profiling identified various DAMs after traumatic injury that are linked to human endothelial dysfunction. Future experiments should expand the number of metabolites measured to determine the underlying signaling pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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