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Enregistrement W4411718893 · doi:10.1093/treephys/tpaf072

Genetic and geographic determinants of nitrogen isotope discrimination in black cottonwood (<i>Populus trichocarpa</i>)

2025· article· en· W4411718893 sur OpenAlexafffund
Yi Hu, Jaroslav Klápště, Xuyang Lu, Raju Soolanayakanahally

Notice bibliographique

RevueTree Physiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBioenergy crop production and management
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesInstitute of Mountain Hazards and EnvironmentAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of ChinaChina Postdoctoral Science FoundationGenome British ColumbiaGenome Canada
Mots-clésPopulus trichocarpaSalicaceaeδ15NBiologyBotanyWoody plantδ13CStable isotope ratioGeneGeneticsGenomePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genotypic variation in nitrogen-use traits remains largely unexplored in trees on a range-wide scale, either in field studies or under controlled experiments. Understanding natural variation in nitrogen-related traits and their relationships to climate is essential for studying local adaptation and advancing breeding efforts. In this study, we took advantage of a large collection of black cottonwood genotypes covering a major portion of the species' natural range, to study the genetic variation in nitrogen isotope discrimination (Δ15N). Nearly 350 unrelated wild genotypes were grown under steady-state hydroponic conditions and analyzed for growth and Δ15N-related traits. Differences in biomass, root-to-shoot ratio, whole-plant and organ-level nitrogen percentages, and Δ15N were found between genotypes and populations. Leaf nitrogen percentage and root-to-shoot ratio were significantly correlated to geographic and climatic variables, implying natural selection for lower leaf nitrogen and lower root-to-shoot ratio in regions with longer growing seasons and a lower risk of drought. Root Δ15N and (less so) leaf Δ15N correlated with geographic and climatic variables, and measurements from either tissue provide a reasonable indication of plant nitrogen uptake efficiency. A genome-wide association study was conducted on leaf and root Δ15N, leaf nitrogen percentage and root-to-shoot ratio. The analysis identified a candidate gene encoding glutaminyl-tRNA synthetase linked to root Δ15N, but found no significant associations with genes involved in nitrate transport or assimilation. However, multiple associations were detected for root-to-shoot ratio and leaf nitrogen percentage, both of which affect isotope-based calculations of root nitrogen efflux/influx and leaf nitrogen assimilation activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,715
Score d'incertitude au seuil0,195

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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