Single cell mass spectrometry reveals intercellular compartmentalization of camptothecin biosynthesis in the tree <i>Camptotheca acuminata</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The medicinal tree Camptotheca acuminata produces camptothecin, a monoterpenoid indole al- kaloid (MIA) precursor for several leading chemotherapeutic agents (Lorence and Nessler 2004). Alt- hough the biosynthesis of camptothecin remains poorly understood, a putative route has been hypothe- sized based on in planta metabolite profiling and feeding studies (Fig. 1a) (Sheriha and Rapoport 1976; Sadre et al. 2016). However, pathways proposed on whole-tissue or organ-level metabolomic and tran- scriptomic data lack resolution on the intricate, cell-specific compartmentalization of natural products biosynthesis. Such gaps could be addressed by single cell technologies, which have recently shown tremendous potential to transform gene discovery in herbaceous plants (Li et al. 2023; Zhan et al. 2023; Vu et al. 2024; Wu et al. 2024; McClune et al. 2025). Nevertheless, single cell mass spectrometry (scMS) has not been adapted for woody species, largely due to the challenges associated with their highly lignified tissue and complex cellular architecture. In this study, we developed an scMS pipeline for the woody tree C. acuminata to investigate the intercellular organization of camptothecin biosynthesis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».