Hybridization and Asymmetrical Introgression Between the Vulnerable Gray‐Headed Chickadee and a More Abundant Congener, the Boreal Chickadee: Implications for Conservation
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Hybridization is a common process among bird species that can precipitate a mix of positive or negative species outcomes. Particularly for rare populations, detrimental effects of hybridization on demographic growth rates and genetic integrity are of serious concern. In Alaska and a small region of northwestern Canada, the endemic subspecies of Gray‐headed Chickadee ( Poecile cinctus lathami ) has declined in recent decades from being locally common to being extremely rare. The more widespread Boreal Chickadee ( P. hudsonicus ) has become increasingly abundant in areas of sympatry. These changes in abundance may have led to hybridization between Gray‐headed Chickadees and Boreal Chickadees. We used a series of analyses to test for signatures of introgression at mitochondrial DNA and nuclear DNA using historical museum samples of both species collected between 1875 and 1979 as well as contemporary Boreal Chickadee samples. In addition, we modeled Gray‐headed Chickadee and Boreal Chickadee demographic histories to better understand patterns of effective population size changes and gene flow over time. Introgression of Gray‐headed Chickadee nuclear DNA was detected in contemporary and historical Boreal Chickadee populations, and two first‐generation hybrid backcrosses were observed in the historical Boreal Chickadee samples. Lack of mitochondrial DNA introgression or backcrossing into the Gray‐headed Chickadee historical samples may be an artifact of mate scarcity during the period before local abundances of Boreal Chickadee exceeded Gray‐headed Chickadees. Demographic modeling with nuclear loci estimated a low level of symmetric gene flow between Gray‐headed Chickadees and Boreal Chickadees since the time of divergence. Our study suggests that hybridization may be linked to Gray‐headed Chickadee declines and represents a case study of how museum collections can be used to infer introgression in a population too scarce to directly investigate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».