4,000-year-old Mycobacterium lepromatosis genomes from Chile reveal long establishment of Hansen’s disease in the Americas
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterium lepromatosis is a recently identified cause of Hansen's disease, and is associated with the more severe and potentially lethal presentations of diffuse lepromatous leprosy and Lucio's phenomenon. Detection of this infection has been limited to a small number of individuals, leaving much to be learned about its global distribution and transmissibility. Its discovery in wild rodent populations in the United Kingdom and Ireland also raises questions about its zoonotic potential. Here, we raise further awareness of this disease via analyses of two exceptionally well preserved M. lepromatosis genomes obtained from 4,000-year-old human remains of two adult males from the archaeological sites of El Cerrito and La Herradura in Northern Chile. This formed the basis of genomic comparisons between ancient and modern forms of the pathogen. We demonstrate an unexpected long history of M. lepromatosis in the Americas, which contrasts with the more recent Eurasian history of the closely related Mycobacterium leprae. We offer relevant perspectives on its evolution while providing an incentive for further disease monitoring in both humans and other potential reservoir species in the Americas and elsewhere.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».