Quantifying Protein–Glycan Interactions Using Native Mass Spectrometry
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Interactions between glycan-binding proteins (GBPs) and carbohydrates (glycans) are essential to many biological processes relevant to human health and disease. For most GBPs, however, their glycan interactome-the repertoire of glycans recognized and their specificities-is poorly defined. The structural diversity of biologically relevant glycans and their limited availability in purified form, as well as their varied presentation, often as glycoconjugates, and weak affinities are key challenges hindering comprehensive glycan interaction mapping. Native mass spectrometry (nMS), a versatile, sensitive and label-free tool for the discovery of GBP-glycan interactions and quantifying their stoichiometry and thermodynamic parameters, is poised to play a leading role in defining the glycan interactome of GBPs. Here, we review established nMS methodologies, as well as important experimental and instrumental considerations, for detecting GBP-glycan interactions in vitro, and reliably measuring their stoichiometry and affinity. Recent advances in nMS methods for high-throughput library screening, including shotgun glycomics, and quantifying GBP interactions with glycoproteins and glycosphingolipids, are also described.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle