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Enregistrement W4411857544 · doi:10.1038/s42003-025-08368-2

Opposing role of phagocytic receptors MERTK and AXL in Progranulin deficient FTD

2025· article· en· W4411857544 sur OpenAlexaff
Claire D. Clelland, Li Fan, Rowan Saloner, Jon Iker Etchegaray, Chad R. Altobelli, Sally Salomonsson, Alisha M. Birk, Aradhana Sachdev, Jingjie Zhu, Se-In Lee, Yaqiao Li, Yungui Zhou, David Le, Chao Wang, Gillian Carling, Lay Kodama, Faten A. Sayed, Jaun A Perez-Bermejo, Ethan G. Geier, Jennifer S. Yokoyama, Howie Rosen, Alissa L. Nana, Salvatore Spina, Lea T. Grinberg, William W. Seeley, Fanny M. Elahi, Adam L. Boxer, Michelle R. Arkin, Li Gan

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeAlzheimer's AssociationNational Institute of General Medical SciencesUniversity of California, San FranciscoNational Institute on AgingNational Institutes of Health
Mots-clésMERTKGAS6MicrogliaFrontotemporal dementiaBiologyNeurodegenerationCancer researchReceptorImmunologyInflammationDiseaseMedicinePathologyDementiaGeneticsReceptor tyrosine kinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic mutations in the progranulin gene, GRN, cause frontotemporal dementia and a lysosomal storage disorder. Using single-nuclei RNA sequencing of the post-mortem brain tissue from adult heterozygous pathogenic granulin variant (GRN+/-) carriers we find dysregulation of microglia, phagocytosis and the phagocytic receptors MERTK and AXL. Exogenous progranulin regulates MERTK and AXL RNA expression in human microglia induced from iPSCs irrespective of GRN mutation status, without directly binding to MERTK or AXL proteins. We generated double knock-out mice and find that constitutive homozygous loss of Grn and Mertk (Grn-/-;Mertk-/-) rescued microglial disease signature while constitutive homozygous loss of Grn and Axl (Grn-/-;Axl-/-) worsened the microglial disease signature and increased lipofuscin. Lower CSF MERTK but not AXL is associated with lower progranulin levels. Furthermore, CSF MERTK is lower in symptomatic but not presymptomatic FTD patients with genetic mutations (GRN, C9ORF72, and MAPT) whereas AXL does not change between disease state and control. These data explain in part the inflammation seen in GRN-FTD and are applicable to other inflammatory states in which PGRN, MERTK and AXL play regulatory roles beyond neurodegenerative diseases. The interaction between GRN, MERTK, and AXL opens potential new therapeutic avenues to intervene on this inflammatory axis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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