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Enregistrement W4411882021 · doi:10.1038/s41467-025-60800-7

Neurons exploit stochastic growth to rapidly and economically build dense dendritic arbors

2025· article· en· W4411882021 sur OpenAlexafffund
Xiaoyi Ouyang, Sabyasachi Sutradhar, Olivier Trottier, Sonal Shree, Qiwei Yu, Yuhai Tu, Jonathon Howard

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFlatiron HealthPrinceton UniversityHarold Whitworth Pierce Charitable TrustNational Institutes of HealthPew Charitable TrustsYale UniversityU.S. Department of Health and Human ServicesNational Science Foundation
Mots-clésBranching (polymer chemistry)IsotropyDendrite (mathematics)SomaNucleationFractalStatistical physicsTopology (electrical circuits)Exponential growthBiological systemPhysicsGeometryComputer scienceMathematicsBiologyMaterials scienceMathematical analysisNeuroscienceCombinatorics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dendrites grow by stochastic branching, elongation, and retraction. A key question is whether such a mechanism is sufficient to form highly branched dendritic morphologies. Alternatively, does dendrite geometry depend on signals from other cells or from the topological hierarchy of the growing network? To answer these questions, we developed an isotropic and homogenous mean-field model in which branch dynamics depends only on average lengths and densities: that is, without external influence. Branching was modeled as density-dependent nucleation so that no tree structures or network topology was present. Despite its simplicity, the model predicted several key morphological properties of class IV Drosophila sensory dendrites, including the exponential distribution of branch lengths, the parabolic scaling between dendrite number and length densities, the tight spacing of the dendritic meshwork (which required minimal total branch length), and the radial orientation of branches. Stochastic growth also accelerated the overall expansion rate of the arbor. We show that stochastic dynamics is an economical and rapid space-filling mechanism for building dendritic arbors without external guidance or hierarchical branching mechanisms. Our work therefore provides a general theoretical framework for understanding how macroscopic branching patterns emerge from microscopic dynamics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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