Mapping, validation, and development of markers for the major adult plant stripe rust resistance locus QYr.hnk-7DL in Henan wheat
Notice bibliographique
Résumé
Historically, Henan Province has encountered multiple significant incidents of wheat cultivars resistance loss due to the emergence of new species of stripe rust fungus. To identify resistant germplasms exhibiting superior resistance to the emerging CRY34 strain, we employed a wheat 660 K array to genotype 256 Henan cultivars and conducted a genome-wide association study (GWAS) on adult plant resistance (APR) to wheat stripe rust in 2021–2022 and 2022–2023. A total of 48 SNP markers were found to be significantly correlated with APR. Fifteen were consistently detected using multi-locus GWAS methods in both BLUP values and in at least one field season. Among these 15 stable quantitative trait nucleotides (QTNs), 12 were previously reported and three were novel. The major novel QTN QYr.hnk-7DL was located at chr07DL_AX-111,720,006 . Twelve associated cultivars possessing this QTN demonstrated high APR to stripe rust, with a 4.69% favorable genotype frequency. The chr07DL_AX-111,720,006 SNP was developed into the KASP marker KASP-YrZM1354 for easier detection. The validity of QYr.hnk-7DL was confirmed using KASP-YrZM1354 in two natural populations and three F 2 populations. Through gene expression analysis within the candidate interval region, TraesCS7D01G544100 (designated YrZM1354 ) was identified as the candidate gene for QYr.hnk-7DL . we identified and verified the major QTN QYr.hnk-7DL associated with APR to stripe rust, elucidated the candidate gene YrZM1354 at this locus, and developed the high-precision marker KASP-YrZM1354 . This marker has been successfully used in resistant germplasm screening and wheat breeding.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».